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中國(guó)農(nóng)科院油料所完成芝麻全基因組關(guān)聯(lián)分析

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2015-10-21  來(lái)源:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所  作者:魏鑫  瀏覽次數(shù):170
 
    近日,從中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所獲悉,張秀榮研究員領(lǐng)銜的芝麻與特色油料遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)與中國(guó)科學(xué)院合作,在國(guó)際上率先完成了芝麻高密度單倍型圖譜構(gòu)建和主要農(nóng)藝性狀大規(guī)模的全基因組關(guān)聯(lián)分析,發(fā)掘了一批關(guān)聯(lián)位點(diǎn)和候選基因。相關(guān)研究成果于2015年10月19日在線發(fā)表在國(guó)際知名期刊《自然通訊(Nature Communications)》雜志上。


    據(jù)悉,芝麻是重要的油料作物,含油量高,富含不飽和脂肪酸、芝麻素等人體有益物質(zhì)。芝麻為二倍體,基因組較小,是油脂相關(guān)性狀研究的理想作物。該團(tuán)隊(duì)在前期完成芝麻基因組測(cè)序的基礎(chǔ)上,篩選來(lái)自世界29個(gè)國(guó)家的芝麻資源705份進(jìn)行了全基因組測(cè)序,發(fā)掘500多萬(wàn)個(gè)核苷酸變異(SNP),構(gòu)建了高密度芝麻單倍型圖譜。對(duì)世界芝麻資源的遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn)芝麻資源分化為南方和北方兩個(gè)生態(tài)類型。對(duì)油脂和產(chǎn)量相關(guān)的56個(gè)重要農(nóng)藝性狀進(jìn)行了全基因關(guān)聯(lián)分析,獲得關(guān)聯(lián)位點(diǎn)549個(gè),候選基因46個(gè)。

    對(duì)芝麻含油量的遺傳分析表明芝麻含油量不僅受油脂代謝酶類調(diào)控,還收到其他基因調(diào)控,如種皮顏色控制基因(SiPPO)和木質(zhì)素合成基因(SiNST1)影響。這一發(fā)現(xiàn)為油料作物含油量的遺傳改良提供了新的思路。通過(guò)對(duì)芝麻種子脂肪酸成分的關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)了脂肪酸代謝關(guān)鍵基因KASI、DGAT、FATA、FATB、SAD等,初步解析了芝麻油脂代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。研究還發(fā)現(xiàn)芝麻一系列產(chǎn)量相關(guān)基因,這些基因的優(yōu)異等位基因的積累是芝麻育成品種產(chǎn)量較地方種高的重要因素。

    該研究得到了973、國(guó)家自然科學(xué)基金、院科技創(chuàng)新工程、物種保護(hù)專項(xiàng)、現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系和國(guó)家公益性科研院所專項(xiàng)的資助。

    論文全文鏈接:http://www.nature.com/ncomms/2015/151019/ncomms9609/full/ncomms9609.html
 
 
 
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