近日,中科院上海辰山植物科學(xué)研究中心和中國科學(xué)院上海植物生理生態(tài)研究所聯(lián)合德國馬普學(xué)會分子遺傳研究所和分子植物生理研究所的科研團隊,在國際學(xué)術(shù)期刊NaturePlants上共同發(fā)表了揭示甘薯起源的重要論文。這是科學(xué)界在多倍體基因組學(xué)領(lǐng)域取得的一項重要突破。
我國以占世界總種植面積50%的土地生產(chǎn)了全球80%以上的甘薯,產(chǎn)量近億噸。但是,復(fù)雜的遺傳背景一直以來是制約甘薯研究的瓶頸,甘薯起源問題懸而未決。此次中德科學(xué)家繪制了甘薯基因組圖譜,揭示了這一重要作物的物種起源歷史。
甘薯基因組共有約4.4億個堿基對,單組大小在700M到800M之間。雖然近年來高通量測序技術(shù)日新月異,但解析多倍體基因組仍然面臨著巨大的障礙。該研究不僅將絕大部分基因組序列定位到對應(yīng)染色體上,還通過全新生物信息學(xué)方法,將六倍體的六組染色體分開,從而揭示:在甘薯的90條染色體中,有30條染色體來源于其二倍體祖先種,另外60條染色體來源于其四倍體祖先種;約50萬年前,二倍體祖先種和四倍體祖先種之間的一次種間雜交孕育了今天的重要作物。這一發(fā)現(xiàn)解決了甘薯起源的謎題,為合理利用甘薯近源野生種提供了嶄新的思路。 中科