近日,中國農(nóng)業(yè)科學院蔬菜花卉研究所種質(zhì)資源團隊在人工合成的蘿卜×甘藍(RRCC)異源四倍體中建立基因組加速演化的研究模型,揭示了異源多倍體植物基因組早期演化特征,通過基因編輯促進了同祖染色體重組和染色體剔除,首次誘導了能使配子迅速降倍的次級減數(shù)分裂。
該研究在多倍體人工演化研究、種質(zhì)資源創(chuàng)新和遺傳育種領(lǐng)域具有廣闊應(yīng)用前景,相關(guān)研究成果發(fā)表在《核酸研究(Nucleic Acids Research)》上。
十字花科包含蘿卜、白菜、甘藍、油菜、芥菜等重要的蔬菜作物、油料作物和調(diào)料作物,遠緣雜交被廣泛地應(yīng)用于十字花科作物的種質(zhì)創(chuàng)新和遺傳育種,蘿卜屬和蕓薹屬作物分別獨立進化出對方稀缺的優(yōu)良性狀和抗性基因。但是,屬間基因組的重組困難制約了優(yōu)良基因的穿梭轉(zhuǎn)育,使得遠緣雜交育種難以取得實質(zhì)性突破。

圖片說明:基因編輯促進染色體重排和基因定點轉(zhuǎn)換
為了解決這一問題,研究團隊前期創(chuàng)制和引進了大量遠緣雜交新種質(zhì)。該研究首先對一份自交8代以上的蘿卜×甘藍(RRCC)異源四倍體基因組測序,揭示了多倍體基因組的早期演化,發(fā)現(xiàn)人工合成的異緣多倍體中基因組的刪除速度很快,而基因組重排速度要慢得多。核心基因和高頻基因傾向于保留,而特有基因和低頻基因傾向于丟失。大片段的染色體刪除富集在異染色質(zhì)區(qū),可能是染色體斷裂產(chǎn)生?;蚪M間的轉(zhuǎn)座主要發(fā)生在同源片段之間,并以短片段為主,表明基因轉(zhuǎn)換是遠緣雜種基因組間遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移的主要途徑。
為加速基因組重排,研究團隊在蘿卜×甘藍上建立了高效的基因編輯技術(shù)。通過編輯FANCM基因,提高了部分同源染色體的重組效率,并首次誘導了能使配子基因組迅速降倍的次級減數(shù)分裂。通過編輯FLIP基因,成功實現(xiàn)基因定點轉(zhuǎn)換,創(chuàng)制了目標位點嵌合新基因。
當前的育種面臨嚴峻的資源限制和技術(shù)瓶頸。如果把每個基因比作一張牌,那么一個優(yōu)良的品種或一份優(yōu)異的骨干親本則是育種家幸運地抓到的一副好牌,其形成和獲得具有很強的偶然性。該研究則賦予育種家洗牌、分牌和換牌的主動權(quán),因而,這一革命性新技術(shù)將突破親緣關(guān)系對種質(zhì)資源可用性的制約,創(chuàng)制具有遠緣優(yōu)勢的新品種、新材料和新基因。