海南三亞崖州區(qū),中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院國家南繁研究院,一個5.7米高、21米寬的“龍門吊”在試驗田中緩緩移動,根據(jù)科研人員輸入的指令,有序掃描田間的作物。
“龍門吊”學(xué)名叫軌道式高通量植物表型采集平臺,沿著布設(shè)的軌道,可以到達田間任何一個點位。這塊試驗田面積近1.5畝,種著水稻、大豆、玉米、棉花等1000多份育種材料,“龍門吊”約30秒就可以完成一個種質(zhì)材料的采集。
“龍門吊”的核心是一臺表型采集設(shè)備。“該設(shè)備集成了多光譜等6種高精度的圖像采集傳感器,掃描時,它們就像6雙‘眼睛’,實時采集植物的表型數(shù)據(jù)。”中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院國家南繁研究院作物表型組學(xué)研究團隊首席專家金秀良說,“整個過程就像給植物照‘CT’。”
表型是植物可以被觀察或鑒定的特征,包括高矮、莖稈粗細、節(jié)間長短、產(chǎn)量高低等。農(nóng)業(yè)育種,觀察、了解作物生長情況是最基礎(chǔ)的工作。掌握豐富、可靠的表型數(shù)據(jù),育種家才能通過篩選,找出所需的育種材料。
為什么要布置高通量植物表型采集設(shè)備?原來,傳統(tǒng)育種主要靠人工,從株苗開始,在田間觀察、記錄成千上萬個植株的每一個特征,這一過程效率低,也難以持續(xù)觀測動態(tài)數(shù)據(jù)。“為了滿足現(xiàn)代育種需求,表型采集必須高效、精準。”金秀良說。
試驗田上還盤旋著一架無人機,它不時變換位置,拍攝作物影像。“無人機靈活、覆蓋范圍廣,‘龍門吊’采集信息精細、針對性強,再加上衛(wèi)星遙感觀測數(shù)據(jù),我們能夠全周期、全天候監(jiān)測作物的生長情況。”作物表型組學(xué)研究團隊成員李藝超測算,借助高通量、智能化設(shè)備,表型采集效率是人工方法的4至5倍。
采集的數(shù)據(jù)傳輸?shù)綌?shù)據(jù)分析中心,供科研人員查閱、分析和處理。“瞧,這是我們‘拍’的作物三維圖像,一些表型數(shù)據(jù)清晰可見。”金秀良指著電腦屏幕說,“傳感器還能發(fā)現(xiàn)人工采集不到的信息。”
金秀良團隊通過操作“龍門吊”持續(xù)監(jiān)測玉米生長過程。干旱是玉米減產(chǎn)的重要因素,他們試圖通過分析玉米的表型數(shù)據(jù),找出產(chǎn)量高、抗旱性能好的遺傳材料資源。
要想利用好表型采集技術(shù),還需要處理數(shù)據(jù)的科學(xué)方法。研究團隊的另一項重要工作是:基于表型數(shù)據(jù)開發(fā)算法和模型,來指導(dǎo)育種工作。
中國農(nóng)科院南繁院副院長李慧慧是金秀良的合作者之一,她正帶領(lǐng)團隊開發(fā)基因組選擇模型、全流程智慧育種平臺等算法工具。
“我們初步取得了一些成果,比如,將機器學(xué)習(xí)算法和表型數(shù)據(jù)等融合,識別出控制作物抗逆和高產(chǎn)的關(guān)鍵基因。”李慧慧說。
借助大數(shù)據(jù)和人工智能手段,金秀良和團隊還希望找到估算作物動態(tài)表型性狀和產(chǎn)量的方法。
“有了這個方法,我們就能精準預(yù)測作物后代表型,優(yōu)化育種方案。”金秀良說,過去尋找理想遺傳材料可能需要監(jiān)測上萬個材料,提前了解材料表型能大幅減少工作量,將來只需要觀察500個左右,極大提升育種效率。
目前,中國農(nóng)科院南繁院已聚集18支科研團隊、200多名科研人員??蒲袠抢锶藖砣送?,智慧育種“新賽道”,在這里越走越寬。